معاونت سد و نیروگاه و تاسیسات زیربنایی شامل مطالعه، شناخت، مرحله اول (امکان‌سنجی)، مرحله دوم (طراحی تفصیلی) و نظارت بر اجرای طرح‌های سد و نیروگاه، نیروگاه‌های حرارتی و تاسیسات زیربنایی در سطح ملی و بین‌المللی می‌شود.
معاونت آبیاری، زهکشی و کشاورزی به‌عنوان یکی از قدیمی‌ترین مجموعه‌های فنی و مهندسی در کشور، در مراحل مختلف شناخت، امکان‌سنجی، طراحی تفصیلی، بهسازی، تهیه اسناد مناقصه، برگزاری مناقصات می‌پردازد.
معاونت حمل‌ونقل، شهرسازی و اجرایی یکی از ارکان اصلی سازمان به‌شمار می‌آید که مأموریت آن هدایت و راهبری پروژه‌های عمرانی و زیرساختی در حوزه‌های حمل‌ونقل، توسعه شهری و امور اجرایی است.
مدیریت ژئوماتیک شرکت مهندسی مشاور مهاب قدس، با بیش از ۴۰ سال تجربه در اجرای پروژه‌های ملی و بین‌المللی، به‌عنوان یکی از مجموعه‌های پیشرو در حوزه تخصصی نقشه‌برداری شناخته می‌شود.
معاونت آب و فاضلاب با بیش از ۴۰ سال سابقه، تاکنون مطالعه، طراحی و نظارت بر بیش از ۴۵۰ پروژه موفق را به اتمام رسانده است. این معاونت به ارائه راه‌حل‌های جامع و تخصصی در بخش آب و فاضلاب می‌پردازد.
شرکت مهندسی مشاور مهاب قدس، با توجه به چالش‌های روزافزون منابع آب، تغییرات اقلیمی، «امور مطالعات یکپارچه منابع آب، خاک و محیط‌زیست» را با هدف نهادینه‌سازی نگرش جامع و چندرشته‌ای در مدیریت آب و توسعه پایدار تأسیس کرد.
معاونت بازاریابی و سرمایه‌گذاری شرکت مهندس مشاور مهاب قدس، بازوی راهبردی شرکت در توسعه بازارهای مهندسی داخل و خارج از کشور است.